RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602848.5

PPFIA3-211, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPFIA3, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-211ENST00000602848 COL20A1Q9P218 1284 aa24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3-211ENST00000602848 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 IRF6O14896 467 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RPA1P27694 616 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PPP1R2P41236 205 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.584e-8■■■■□ 20.7
PPFIA3-211ENST00000602848 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
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PPFIA3-211ENST00000602848 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 LRRC15Q8TF66 581 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 OTUD5Q96G74 571 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 WNK4Q96J92 1243 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RIT2Q99578 217 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 VAV3Q9UKW4 847 aa24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 KLRC4O43908 158 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TPM3P06753 285 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 MUTP22033 750 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 FKBP1BP68106 108 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PPP2R5CQ13362 524 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ACAD9Q9H845 621 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PSMD10O75832 226 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RIPK3Q9Y572 518 aa24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TREML2Q5T2D2 321 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 GJA10Q969M2 543 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 JADE2Q9NQC1 790 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 FBXO40Q9UH90 709 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 NSMFQ6X4W1 530 aa24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RMDN3Q96TC7 470 aa24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PXMP2Q9NR77 195 aa24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 UBXN2AP68543 259 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 STIM1Q13586 685 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 MCM6Q14566 821 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PGM5Q15124 567 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 SPATA1Q5VX52 437 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 MOB2Q70IA6 237 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 OPTNQ96CV9 577 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 GAS7O60861 476 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ASIC1P78348 528 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 FSTL1Q12841 308 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 EXOC1Q9NV70 894 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 TRAF5O00463 557 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 MAFGO15525 162 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ITGB5P18084 799 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 COPB2P35606 906 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PSMD2Q13200 908 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 ECM1Q16610 540 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 UNC13DQ70J99 1090 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 FANCLQ9NW38 375 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 DNM3Q9UQ16 869 aa24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 PASKQ96RG2 1323 aa24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3-211ENST00000602848 MYMKA6NI61 221 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 CBFA2T2O43439 604 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 MED24O75448 989 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 STAM2O75886 525 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 ARP10275 920 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 OSBPP22059 807 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3-211ENST00000602848 NEK9Q8TD19 979 aa24.89■■□□□ 1.57
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