RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A2P36021 539 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 BEX3Q00994 111 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RIPK3Q9Y572 518 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 BRWD1Q9NSI6 2320 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CYTH3O43739 400 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBED4O75132 1171 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIN2DO15399 1336 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OAZ1P54368 228 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL4Q14679 1199 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMCX2Q7L311 632 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ARNTL2Q8WYA1 636 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SCLYQ96I15 445 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF3AQ9Y496 699 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM3APO60318 1980 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB5O15062 677 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 B4GALT4O60513 344 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 DEXIO95424 95 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CTDNEP1O95476 244 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 WASF1Q92558 559 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FGD4Q96M96 766 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KATNBL1Q9H079 304 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2A1O14983 1001 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFAIP2Q03169 654 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TAP1Q03518 808 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CPVLQ9H3G5 476 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PHKBQ93100 1093 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ASTN1O14525 1302 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NHLH1Q02575 133 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GRB10Q13322 594 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD35Q8N283 1001 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGSQ96S52 555 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9A7Q96T83 725 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ZEB2O60315 1214 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ICAM1P05362 532 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTN1P12814 892 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 HOMER1Q86YM7 354 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 AMNQ9BXJ7 453 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SCG2P13521 617 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A3P48751 1232 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO11Q86XK2 927 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GJD3Q8N144 294 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 UIMC1Q96RL1 719 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 AP5M1Q9H0R1 490 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNH6Q9H252 994 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO40Q9UH90 709 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF28PB7ZC32 967 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 JAK2O60674 1132 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 LPXNO60711 386 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ALADP13716 330 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TKFCQ3LXA3 575 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TLK2Q86UE8 772 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM178BQ8IXR5 827 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CPXCR1Q8N123 301 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS22Q8NE09 1264 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF15O94989 841 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 XBP1P17861 261 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST13Q8NET6 341 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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