RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592446.1

CNP-211, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-211ENST00000592446 SESTD1Q86VW0 696 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 SCLYQ96I15 445 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.06■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 RCAN1P53805 252 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 ZNF697Q5TEC3 545 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 Q6ZUG5 572 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 VWCEQ96DN2 955 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 FAM161BQ96MY7 647 aa27.05■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 F2P00734 622 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 FGBP02675 491 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 ZNF286BP0CG31 522 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 CDC27P30260 824 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 PSEN2P49810 448 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 SEMA3FQ13275 785 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 MFSD10Q14728 455 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 PTGISQ16647 500 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 UBE2SQ16763 222 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 HERVK_113Q902F9 699 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 HAS3O00219 553 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 FIBPO43427 364 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 APOBRQ0VD83 1088 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 ALG1Q9BT22 464 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 SEMA6BQ9H3T3 888 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 NOD1Q9Y239 953 aa27.03■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 RPS6KB1P23443 525 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 NEDD9Q14511 834 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 C7orf31Q8N865 590 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 BRF1Q92994 677 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 GUCD1Q96NT3 240 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.02■■□□□ 1.92
CNP-211ENST00000592446 PITPNM1O00562 1244 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 PSMA5P28066 241 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 BFSP2Q13515 415 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 METTL7BQ6UX53 244 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 FBXL16Q8N461 479 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 RETREG2Q8NC44 543 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.01■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 SPDYE3A6NKU9 549 aa27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 NAPAP54920 295 aa27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 NLRX1Q86UT6 975 aa27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 SENP7Q9BQF6 1050 aa27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 IQCF3P0C7M6 154 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 USP26Q9BXU7 913 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.99■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 STXBP3O00186 592 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 ITGB5P18084 799 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 DEFB128Q7Z7B8 93 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 GPRASP2Q96D09 838 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 BARHL2Q9NY43 387 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.98■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 LGALS2P05162 132 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 PFKMP08237 780 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 DNAJB2P25686 324 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 RFC2P35250 354 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 CAGE1Q8TC20 777 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 GPR20Q99678 358 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.97■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 SMCO2A6NFE2 343 aa26.96■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 H3BRB1 525 aa26.96■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.96■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 ATP9AO75110 1047 aa26.96■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.96■■□□□ 1.91
CNP-211ENST00000592446 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms