RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 HERVK_113P62684 666 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 DPYDQ12882 1025 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 HYIQ5T013 277 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 NEK9Q8TD19 979 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRFP10586 1907 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PP2D1A8MPX8 630 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 IKBKBO14920 756 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNA1P78396 465 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 DNERQ8NFT8 737 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC5A5Q92911 643 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 WNK4Q96J92 1243 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 IWS1Q96ST2 819 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PXMP2Q9NR77 195 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEMA6NI47 508 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAF5O00463 557 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC25AP30304 524 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MORC3Q14149 939 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNB1Q14721 858 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 GNPTABQ3T906 1256 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 LENG9Q96B70 501 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 JADE2Q9NQC1 790 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R5CQ13362 524 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH8Q9H579 483 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 RLFQ13129 1914 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PASKQ96RG2 1323 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 RPA1P27694 616 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL5Q02045 173 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR1Q13613 665 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PGM5Q15124 567 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD54LQ92698 747 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 GPRASP2Q96D09 838 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 DNM3Q9UQ16 869 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR29P0C7W0 189 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 VEGFBP49765 207 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCB2Q00722 1185 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 LUZP1Q86V48 1076 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC1Q9NV70 894 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 UBXN2AP68543 259 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GRB10Q13322 594 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 RIPK3Q9Y572 518 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEB2H3BUK9 544 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 NR3C2P08235 984 aa25.31■■□□□ 1.64
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