RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BTBD7Q9P203 1132 aa9.23□□□□□ -0.93
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GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KIF28PB7ZC32 967 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 GPAA1O43292 621 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BMP15O95972 392 aa9.22□□□□□ -0.93
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GGA3-218ENST00000584243 CPA1P15085 419 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 XBP1P17861 261 aa9.22□□□□□ -0.93
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GGA3-218ENST00000584243 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ADALQ6DHV7 355 aa9.22□□□□□ -0.93
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GGA3-218ENST00000584243 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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GGA3-218ENST00000584243 TET1Q8NFU7 2136 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ERICH2A1L162 156 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 LINC01565O15544 149 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CCP110O43303 1012 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 PI15O43692 258 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 LRRC24Q50LG9 513 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 GRIN2DO15399 1336 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 EYA4O95677 639 aa9.2□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 ZNF165P49910 485 aa9.2□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CD207Q9UJ71 328 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ADCY6O43306 1168 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 B4GALT4O60513 344 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CALM1P0DP23 149 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CALM2P0DP24 149 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CALM3P0DP25 149 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FGFR2P21802 821 aa9.19□□□□□ -0.94
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