RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 LRRC41Q15345 812 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SV2AQ7L0J3 742 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ATG4CQ96DT6 458 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 IFT43Q96FT9 208 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 SUSD3Q96L08 255 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 EHD4Q9H223 541 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PQY0 241 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CDC14CA4D256 554 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MYADML2A6NDP7 307 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 USP14P54578 494 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CCNA1P78396 465 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 PPM1EQ8WY54 764 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
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PTPRM-206ENST00000578093 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
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