RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575009.5

SRRM2-222, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 5

Gene SRRM2, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-222	ENST00000575009	LAMC2	Q13753	1193 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	IL17RA	Q96F46	866 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	STAM2	O75886	525 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CD4	P01730	458 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	RAG1	P15918	1043 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ICAM3	P32942	547 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CHMP4BP1	P59074	171 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	B4GALT4	O60513	344 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	KPNA6	O60684	536 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	DTNB	O60941	627 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TGFB3	P10600	412 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	AK2	P54819	239 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	PPTC7	Q8NI37	304 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	KAT2B	Q92831	832 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ANO3	Q9BYT9	981 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	FIBP	O43427	364 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ZNF286B	P0CG31	522 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	29.98	■■■□□ 2.39	2e-6	■■■□□ 18.5
SRRM2-222	ENST00000575009	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	SPATA33	Q96N06	139 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ITGB5	P18084	799 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	DGKD	Q16760	1214 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009		A0A1W2PPC1	479 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	SCRN1	Q12765	414 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	NLRX1	Q86UT6	975 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TDH	Q8IZJ6	230 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ESYT2	A0FGR8	921 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	CPLX1	O14810	134 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-222	ENST00000575009	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		29.95	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	ATP9A	O75110	1047 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	TIMP1	P01033	207 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	EPHB4	P54760	987 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	GPRASP2	Q96D09	838 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	LARGE1	O95461	756 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	CYP2C18	P33260	490 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	NEK4	P51957	841 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SP4	Q02446	784 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	AP3B2	Q13367	1082 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	NEDD9	Q14511	834 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	AIFM3	Q96NN9	605 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	ALG1	Q9BT22	464 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	C6orf50	Q9HD87	102 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	PFKFB2	O60825	505 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	CYP2C9	P11712	490 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	PSEN2	P49810	448 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	METTL7B	Q6UX53	244 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	JADE2	Q9NQC1	790 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	KCNA2	P16389	499 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SREBF1	P36956	1147 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	MTMR1	Q13613	665 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	HIPK3	Q9H422	1215 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	PPFIA4	O75335	1185 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	F2	P00734	622 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	FPGS	Q05932	587 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	MFSD10	Q14728	455 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	ANKRD1	Q15327	319 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-222	ENST00000575009	SHH	Q15465	462 aa		29.9	■■■□□ 2.38

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