RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 ADMP35318 185 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 COPS6Q7L5N1 327 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 NLRP10Q86W26 655 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 SHISA5Q8N114 240 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 ATG4CQ96DT6 458 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 ABHD8Q96I13 439 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 RASSF10A6NK89 507 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 ATP2B1P20020 1258 aa7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 EPS15P42566 896 aa7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 TCIRG1Q13488 830 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 FBXL6Q8N531 539 aa7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 MIPEPQ99797 713 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 DYRK3O43781 588 aa7.2□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 ZNF853P0CG23 659 aa7.2□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 FURINP09958 794 aa7.19□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 CXCL9Q07325 125 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.19□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 HTTP42858 3142 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.18□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 IGLV1-40P01703 118 aa7.18□□□□□ -1.26
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GDE1-204ENST00000569773 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 GRAPQ13588 217 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-204ENST00000569773 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.18□□□□□ -1.26
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