RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 NEDD9Q14511 834 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 UBE2SQ16763 222 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 SMCO2A6NFE2 343 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 FPGSQ05932 587 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 AP3B2Q13367 1082 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ESYT2A0FGR8 921 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 CPLX1O14810 134 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 B4GALT4O60513 344 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 IFNAR1P17181 557 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 MCTP2Q6DN12 878 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 MFSD5Q6N075 450 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 GPRASP2Q96D09 838 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SPATA33Q96N06 139 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PPFIA4O75335 1185 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ITGB8P26012 769 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD1Q15327 319 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 NTRK3Q16288 839 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM199Q8N511 208 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 HIPK3Q9H422 1215 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 MAFGO15525 162 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SLC34A2O95436 690 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 GNA11P29992 359 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SP2Q02086 613 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 METTL7BQ6UX53 244 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PHKBQ93100 1093 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 C6orf50Q9HD87 102 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 KAT6AQ92794 2004 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 F2P00734 622 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 SESTD1Q86VW0 696 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 BICD2Q8TD16 824 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 IL17RAQ96F46 866 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ANO3Q9BYT9 981 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 NOD1Q9Y239 953 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 MTMR1Q13613 665 aa22.71■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 PKN1Q16512 942 aa22.71■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.71■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
CMTM3-211ENST00000565922 CDKL5O76039 1030 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PSEN2P49810 448 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CHMP4BP1P59074 171 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SEMA3FQ13275 785 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 KAT2BQ92831 832 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 JADE2Q9NQC1 790 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SORBS3O60504 671 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 DEXIO95424 95 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF286BP0CG31 522 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SREBF1P36956 1147 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 MFSD10Q14728 455 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 GPR153Q6NV75 609 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 C7orf31Q8N865 590 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 HAS3O00219 553 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ITGB5P18084 799 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CYP2C18P33260 490 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 STK3Q13188 491 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SHHQ15465 462 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.68■■□□□ 1.22
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