RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS3O15072 1205 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ACLYP53396 1101 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 BEX3Q00994 111 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR1Q13613 665 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM29Q14134 588 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 NPY5RQ15761 445 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNA10Q16322 511 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 COPS5Q92905 334 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 KAT6AQ92794 2004 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PQY0 241 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ASGR1P07306 291 aa21.53■■□□□ 1.04
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RABGGTA-208ENST00000558954 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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RABGGTA-208ENST00000558954 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 M0R2N6 131 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP55Q53EZ4 464 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 FERMT2Q96AC1 680 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 JADE2Q9NQC1 790 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP290O15078 2479 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MAFGO15525 162 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 GGPS1O95749 300 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP3A4P08684 503 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF76P36508 570 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SEMA3FQ13275 785 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMC2Q13753 1193 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 NEDD9Q14511 834 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF3AQ9Y496 699 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 A6NJR5 290 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CABYRO75952 493 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP3P08254 477 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT2P35908 639 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 FOSBP53539 338 aa21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 PPTC7Q8NI37 304 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 AFG1LQ8WV93 481 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf76Q96K31 380 aa21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 KPNA6O60684 536 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP1P03956 469 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 METTL7BQ6UX53 244 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA33Q96N06 139 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MEIS1O00470 390 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MYL3P08590 195 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 USP11P51784 963 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SNX17Q15036 470 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 DGKDQ16760 1214 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 TBCKQ8TEA7 893 aa21.48■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM86B1E9PN63 330 aa21.47■■□□□ 1.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNA2P16389 499 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CIITAP33076 1130 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OXER1Q8TDS5 423 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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