RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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TMEM260-216ENST00000557657 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.49■■□□□ 1.35
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TMEM260-216ENST00000557657 FAM86B1E9PN63 330 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 NDUFB10O96000 172 aa23.49■■□□□ 1.35
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