RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554304.5

SLC38A6-218, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-218ENST00000554304 MCTP2Q6DN12 878 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TMEM199Q8N511 208 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 IL31RAQ8NI17 732 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PPTC7Q8NI37 304 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SPATA33Q96N06 139 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 BARHL2Q9NY43 387 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NOD1Q9Y239 953 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PPFIA4O75335 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SCG2P13521 617 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 GNA11P29992 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ICAM3P32942 547 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FUT2Q10981 343 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ANKRD1Q15327 319 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 UBE2SQ16763 222 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 C6orf50Q9HD87 102 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 LTBP2Q14767 1821 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 STXBP3O00186 592 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MAFGO15525 162 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 RGS20O76081 388 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CD4P01730 458 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 IFNAR1P17181 557 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 EVCP57679 992 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MFSD5Q6N075 450 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 BICD2Q8TD16 824 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 GPRASP2Q96D09 838 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 HIPK3Q9H422 1215 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TBX21Q9UL17 535 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NID2Q14112 1375 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SORBS3O60504 671 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 ZNF76P36508 570 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 AP3B2Q13367 1082 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 C7orf31Q8N865 590 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 GRIN2DO15399 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 B4GALT4O60513 344 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 CDKL5O76039 1030 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 PSEN2P49810 448 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 STK3Q13188 491 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 METTL7BQ6UX53 244 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 RETREG2Q8NC44 543 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 PHKBQ93100 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 ALG1Q9BT22 464 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 ESYT2A0FGR8 921 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 PRR29P0C7W0 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SP2Q02086 613 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 BFSP2Q13515 415 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 MTMR1Q13613 665 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 MFSD10Q14728 455 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 ANO3Q9BYT9 981 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 DEXIO95424 95 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 SLC34A2O95436 690 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC38A6-218ENST00000554304 XBP1P17861 261 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms