RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-231ENST00000551931 MFSD10Q14728 455 aa14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 C7orf31Q8N865 590 aa14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 PPTC7Q8NI37 304 aa14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.66□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 MYO7AQ13402 2215 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 GJB5O95377 273 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 PTK7Q13308 1070 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 LAMC2Q13753 1193 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 SEC23AQ15436 765 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 IL31RAQ8NI17 732 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 MTMR8Q96EF0 704 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 AMNQ9BXJ7 453 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 KRT23Q9C075 422 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 COG5Q9UP83 839 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-231ENST00000551931 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 SP2Q02086 613 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HLA-CQ95604 372 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 C5orf42Q9H799 3197 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 LINC01553A4QN01 128 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 KLRF2D3W0D1 207 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HIP1O00291 1037 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 ZBTB5O15062 677 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 GGPS1O95749 300 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PGM5Q15124 567 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 RAD9AQ99638 391 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PPFIA4O75335 1185 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 ERVK-21P61565 698 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 AAMPQ13685 434 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 IKBKEQ14164 716 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.075e-8■■■□□ 15.1
LETMD1-231ENST00000551931 HOMER1Q86YM7 354 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 SPATA33Q96N06 139 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 LGR5O75473 907 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 SERINC5Q86VE9 423 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PIGSQ96S52 555 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 SENP2Q9HC62 589 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 TRIOO75962 3097 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CYTH3O43739 400 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 EFCAB14O75071 495 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 THPOP40225 353 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 GRM4Q14833 912 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 RSPH10BP0C881 870 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 POLR2MP0CAP2 368 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 CCND2P30279 289 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 HOXC8P31273 242 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-231ENST00000551931 PLA2G5P39877 138 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms