RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 RPS6KA4O75676 772 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 PLCG2P16885 1265 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 RASSF7Q02833 373 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 KCNMA1Q12791 1236 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 CEP95Q96GE4 821 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.11■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 HSF2BPO75031 334 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 CXCR5P32302 372 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 ADCY7P51828 1080 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SLC7A5Q01650 507 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 RUFY1Q96T51 708 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SLC37A4O43826 429 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 ZPR1O75312 459 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SERPING1P05155 500 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 IFT20Q8IY31 132 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 C8orf37Q96NL8 207 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.1■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 BTDP43251 543 aa26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SLC1A4P43007 532 aa26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SKOR1P84550 965 aa26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 CEP63Q96MT8 703 aa26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 APBA1Q02410 837 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 TEX11Q8IYF3 940 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 PSMB7Q99436 277 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 POTEMA6NI47 508 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 NCK2O43639 380 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 EDIL3O43854 480 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 TDP2O95551 362 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 GNA14O95837 355 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 HINFPQ9BQA5 517 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.08■■□□□ 1.77
NPAS3-211ENST00000551634 GRID2IPA4D2P6 1211 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 USP17L5A8MUK1 530 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 GRAPQ13588 217 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
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NPAS3-211ENST00000551634 GDF3Q9NR23 364 aa26.08■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 CPP00450 1065 aa26.07■■□□□ 1.76
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NPAS3-211ENST00000551634 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 EBAG9O00559 213 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NAB2Q15742 525 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 EHD2Q9NZN4 543 aa26.07■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 BUB1O43683 1085 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 COASYQ13057 564 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 KCNK18Q7Z418 384 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NOL4O94818 638 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 ATP2B2Q01814 1243 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 LRRC41Q15345 812 aa26.06■■□□□ 1.76
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NPAS3-211ENST00000551634 GRIN2DO15399 1336 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 SHTN1A0MZ66 631 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 VGLL3A8MV65 326 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 TRAF5O00463 557 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 TLR2O60603 784 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 PAK2Q13177 524 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 GNGT1P63211 74 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 SMIM5Q71RC9 77 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 MREGQ8N565 214 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 KCNQ4P56696 695 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 SLC18A3Q16572 532 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 HYIQ5T013 277 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 BCAS4Q8TDM0 211 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 COA7Q96BR5 231 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS3-211ENST00000551634 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.04■■□□□ 1.76
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