RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PPTC7Q8NI37 304 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 BARHL2Q9NY43 387 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 TGFB3P10600 412 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PHKBQ93100 1093 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 ADAMTS3O15072 1205 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 STAM2O75886 525 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SEC24BO95487 1268 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 CYP2C18P33260 490 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SPATA33Q96N06 139 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 ZNF286BP0CG31 522 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SCG2P13521 617 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 FPGSQ05932 587 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 DGKDQ16760 1214 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 GNPTABQ3T906 1256 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 MFSD5Q6N075 450 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PGBD1Q96JS3 809 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 FIBPO43427 364 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CYP2C9P11712 490 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ITGB5P18084 799 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ADCY7P51828 1080 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 HIPK3Q9H422 1215 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 TMEM260Q9NX78 707 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SMCO2A6NFE2 343 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 F2P00734 622 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CSF2RAP15509 400 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CHMP4BP1P59074 171 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 IFNAR1P17181 557 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 VWCEQ96DN2 955 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 IL17RAQ96F46 866 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 HAS3O00219 553 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ATP9AO75110 1047 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 PPFIA4O75335 1185 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 PSEN2P49810 448 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ANAPC15P60006 121 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 METTL7BQ6UX53 244 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SESTD1Q86VW0 696 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 GPRASP2Q96D09 838 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ANO3Q9BYT9 981 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 KCNA2P16389 499 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CCL23P55773 120 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 NEDD9Q14511 834 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 MFSD10Q14728 455 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.426e-7■□□□□ 9.5
CS-222ENST00000550996 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ESYT2A0FGR8 921 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ACRP10323 421 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 STK3Q13188 491 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 HIC1Q14526 733 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 NLRX1Q86UT6 975 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 GPR20Q99678 358 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-222ENST00000550996 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 SREBF1P36956 1147 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 AP3B2Q13367 1082 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 TMEM240Q5SV17 173 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-222ENST00000550996 TMEM199Q8N511 208 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms