RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543818.5

LRTM2-208, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,986 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRTM2-208	ENST00000543818	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	NEFH	P12036	1026 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	PSMD2	Q13200	908 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	NR1D1	P20393	614 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	PSEN1	P49768	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	PLS1	Q14651	629 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	ADCY7	P51828	1080 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	CXCR5	P32302	372 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	USP14	P54578	494 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	CEP120	Q8N960	986 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	EHD4	Q9H223	541 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
LRTM2-208	ENST00000543818	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TTLL1	O95922	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	DPEP1	P16444	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	UTRN	P46939	3433 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	MAP2K7	O14733	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	ARID5A	Q03989	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CUL5	Q93034	780 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TEX33	O43247	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	EPHB4	P54760	987 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	ORC4	O43929	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TRIM14	Q14142	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	LRRD1	A4D1F6	860 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	WNT7A	O00755	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	KIF3C	O14782	793 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	MMP14	P50281	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CALCRL	Q16602	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	LRP6	O75581	1613 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	BACH1	O14867	736 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PPP6R2	O75170	966 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SEC24C	P53992	1094 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PDE4D	Q08499	809 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PRR16	Q569H4	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PTPRE	P23469	700 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	POLE2	P56282	527 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TNNC1	P63316	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CRYM	Q14894	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	PKN1	Q16512	942 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	CABP7	Q86V35	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRTM2-208	ENST00000543818	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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