RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 PKN1Q16512 942 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXL16Q8N461 479 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 KAT2BQ92831 832 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TM7SF3-211ENST00000542667 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 TIMP1P01033 207 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ADCY7P51828 1080 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CCL23P55773 120 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SP4Q02446 784 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 LAMC2Q13753 1193 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NTRK3Q16288 839 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SPATA33Q96N06 139 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ALG1Q9BT22 464 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 BARHL2Q9NY43 387 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.45■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NID2Q14112 1375 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP9AO75110 1047 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ACRP10323 421 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SCG2P13521 617 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CSF2RAP15509 400 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ITGB5P18084 799 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 RCAN1P53805 252 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 EVCP57679 992 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 UIMC1Q96RL1 719 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.44■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A1W2PPC1 479 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 FPGSQ05932 587 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 DGKDQ16760 1214 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PPTC7Q8NI37 304 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 HIPK3Q9H422 1215 aa16.43■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 FIBPO43427 364 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 KPNA6O60684 536 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ICAM3P32942 547 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PSEN2P49810 448 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 GNPTABQ3T906 1256 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MFSD5Q6N075 450 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SCLYQ96I15 445 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 AIFM3Q96NN9 605 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ANO3Q9BYT9 981 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.42■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 TGFB3P10600 412 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 IFNAR1P17181 557 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 AK2P54819 239 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 HIC1Q14526 733 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MFSD10Q14728 455 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 Q7L0L9 218 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM50Q86XT4 487 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.41■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SCN5AQ14524 2016 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 STAM2O75886 525 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SCRN1Q12765 414 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PTGISQ16647 500 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 C8orf34Q49A92 452 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NLRX1Q86UT6 975 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 GPR20Q99678 358 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.4■□□□□ 0.22
TM7SF3-211ENST00000542667 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 PPFIA4O75335 1185 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 LARGE1O95461 756 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 F2P00734 622 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 LGALS2P05162 132 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 ARP10275 920 aa16.39■□□□□ 0.21
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNA2P16389 499 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms