RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 MXD3Q9BW11 206 aa9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 FSCN2O14926 492 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 CELA3AP09093 270 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 GLB1P16278 677 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 HSD3B2P26439 372 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 SHHQ15465 462 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 PHC3Q8NDX5 983 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 GPATCH3Q96I76 525 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 RHOVQ96L33 236 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 UBP1Q9NZI7 540 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 LAMB2P55268 1798 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.8□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 NUP98P52948 1817 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 PF4P02776 101 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 CAPN2P17655 700 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 SOX9P48436 509 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 LIG3P49916 1009 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ARTNQ5T4W7 220 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 MKL1Q969V6 931 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 HHIPQ96QV1 700 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 TCF12Q99081 682 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ADAM19Q9H013 955 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 CPA4Q9UI42 421 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 PSME4Q14997 1843 aa9.79□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 OTOFQ9HC10 1997 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 DMDP11532 3685 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 BTBD19C9JJ37 291 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 APOBRQ0VD83 1088 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 PTPROQ16827 1216 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ACAD11Q709F0 780 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 PPM1EQ8WY54 764 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 OSMRQ99650 979 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ZNF521Q96K83 1311 aa9.78□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
LMO3-216ENST00000537568 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SMIM22K7EJ46 135 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KLF4O43474 513 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ADCY3O60266 1144 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 NEFMP07197 916 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 HOXD10P28358 340 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 NKD1Q969G9 470 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 FBXL18Q96ME1 805 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SNTG2Q9NY99 539 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 H3BRJ5 948 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ADAM11O75078 769 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 COL6A1P12109 1028 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 GARTP22102 1010 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TEFQ10587 303 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RAB33AQ14088 237 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PDE3AQ14432 1141 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CCNJLQ8IV13 435 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms