RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM260Q9NX78 707 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ARVCFO00192 962 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 GGPS1O95749 300 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 NEDD9Q14511 834 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 RABEP1Q15276 862 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 NECAB1Q8N987 351 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 AFG1LQ8WV93 481 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 GPRASP2Q96D09 838 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 LARGE1O95461 756 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MMP3P08254 477 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 XBP1P17861 261 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 TLE2Q04725 743 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 IL27Q8NEV9 243 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 WASF1Q92558 559 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 TOX2Q96NM4 488 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 CEP290O15078 2479 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 SYN1P17600 705 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 SREBF1P36956 1147 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 SP2Q02086 613 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ITGA7Q13683 1181 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 DGKDQ16760 1214 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 PPTC7Q8NI37 304 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 MAFGO15525 162 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA33Q96N06 139 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 JADE2Q9NQC1 790 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ST18O60284 1047 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SORBS3O60504 671 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CTDNEP1O95476 244 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CLTBP09497 229 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ITGB5P18084 799 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF76P36508 570 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CDK7P50613 346 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA3FQ13275 785 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR1Q13613 665 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 GALNT17Q6IS24 598 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 PSMC6P62333 389 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP4P98171 946 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 AIFM3Q96NN9 605 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CEP55Q53EZ4 464 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 METTL7BQ6UX53 244 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 BACH2Q9BYV9 841 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 PPFIA4O75335 1185 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CYP3A4P08684 503 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 BLIDQ8IZY5 108 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS3O15072 1205 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 ALG1Q9BT22 464 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 GRIN2DO15399 1336 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-222ENST00000532751 LTBP2Q14767 1821 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 KCNA2P16389 499 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 CHMP4BP1P59074 171 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 FAAP100Q0VG06 881 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms