RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLUL1	Q15846	466 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYH7	P12883	1935 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SI	P14410	1827 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MBTPS2	O43462	519 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	F2	P00734	622 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	LTBR	P36941	435 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOV	P48745	357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IER5L	Q5T953	404 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	HAS3	O00219	553 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTNNB1	P35222	781 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ORC4	O43929	436 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CAND2	O75155	1236 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	HYAL1	Q12794	435 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCF15	Q12870	199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	USH1G	Q495M9	461 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	APBB2	Q92870	758 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	WNT8B	Q93098	351 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCT	P09848	1927 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TECTA	O75443	2155 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDHB	P11177	359 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	BMPR1A	P36894	532 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZXDA	P98168	799 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNAT1	P11488	350 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFV1	P49821	464 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTC14	Q96N46	770 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABCB11	O95342	1321 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRM6	O15303	877 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAM15	Q13444	863 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBX10	O75333	385 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TXNRD1-223	ENST00000531691	EYA4	O95677	639 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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