RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TRPA1O75762 1119 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TIAF1O95411 115 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 EDN3P14138 238 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TM4SF4P48230 202 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TNNI2P48788 182 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 INHBEP58166 350 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 NLRP12P59046 1061 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TIMM10P62072 90 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ATP8B2P98198 1209 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TFCP2Q12800 502 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MTX1Q13505 466 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TNFAIP1Q13829 316 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 RASA3Q14644 834 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MAP3K11Q16584 847 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TEKT1Q969V4 418 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TNFRSF21O75509 655 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TBC1D8O95759 1140 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FUT4P22083 530 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ADORA1P30542 326 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 PHKA1P46020 1223 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ARL4DP49703 201 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SREBF2Q12772 1141 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 GORABQ5T7V8 394 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 HGSNATQ68CP4 663 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SPRED2Q7Z698 418 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 HOOK2Q96ED9 719 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 PBX4Q9BYU1 374 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FZD1Q9UP38 647 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MAST3O60307 1309 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 AOX1Q06278 1338 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 CACNA1SQ13698 1873 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 A0A1B0GUL7 405 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 A6NHS1 94 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 PRDX5P30044 214 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 CACNB3P54284 484 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ECM1Q16610 540 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FAM83AQ86UY5 434 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 GJD3Q8N144 294 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 SSH3Q8TE77 659 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 FAM151AQ8WW52 585 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 GATA6Q92908 595 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ABHD8Q96I13 439 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 WNK4Q96J92 1243 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 TEPSINQ96N21 525 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 GPR108Q9NPR9 543 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 USP40Q9NVE5 1235 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 CNTN3Q9P232 1028 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 ABCF2Q9UG63 623 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC17-211ENST00000530483 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms