RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526445.1

PDE4DIP-222, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NAPA	P54920	295 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DGKD	Q16760	1214 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FIBP	O43427	364 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GGPS1	O95749	300 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NEDD9	Q14511	834 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	UBE2S	Q16763	222 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HAS3	O00219	553 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MAFG	O15525	162 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	F2	P00734	622 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ITGB5	P18084	799 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ADCY7	P51828	1080 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EPHB4	P54760	987 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SEC24B	O95487	1268 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FPGS	Q05932	587 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SHH	Q15465	462 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PHKB	Q93100	1093 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ATP9A	O75110	1047 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KCNA2	P16389	499 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CYP2C18	P33260	490 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SREBF1	P36956	1147 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPR20	Q99678	358 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CYP3A4	P08684	503 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CSF2RA	P15509	400 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GNA11	P29992	359 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PSEN2	P49810	448 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MTMR1	Q13613	665 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MFSD10	Q14728	455 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MEIS1	O00470	390 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PFKFB2	O60825	505 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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