RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1SQ13698 1873 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BMP6P22004 513 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GNG11P61952 73 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GABPAQ06546 454 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NCAPHQ15003 741 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TSG101Q99816 390 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IMPDH2P12268 514 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PRCPP42785 496 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CRYMQ14894 314 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ACER1Q8TDN7 264 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 HPS3Q969F9 1004 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NYAP2Q9P242 653 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NID2Q14112 1375 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CHD4Q14839 1912 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SCN7AQ01118 1682 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ18B7U540 433 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ENTPD3O75355 529 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE6P0CI01 402 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NAT1P18440 290 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ACTN2P35609 894 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DPYDQ12882 1025 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TNFAIP1Q13829 316 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ12Q14500 433 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RASA3Q14644 834 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TNIP1Q15025 636 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF4Q8WV16 495 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF25Q93038 417 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DESI2Q9BSY9 194 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BICDL2A1A5D9 508 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 YDJCA8MPS7 323 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TRAF5O00463 557 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MEIS1O00470 390 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SLC37A4O43826 429 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ALAS1P13196 640 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL9Q07325 125 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PLS1Q14651 629 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC41Q15345 812 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NSMFQ6X4W1 530 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MYH6P13533 1939 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 USP27XA6NNY8 438 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 H7C1D1 291 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TEX33O43247 280 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FLOT1O75955 427 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KRT9P35527 623 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PRPHP41219 470 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 VSTM4Q8IW00 320 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf38Q8TB03 319 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IDI2Q9BXS1 227 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POLD4Q9HCU8 107 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 10.2
TRPS1-208ENST00000519076 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ASNSP08243 561 aa8.67□□□□□ -1.02
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