RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516065.1

RNU6-615P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 615, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-615P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-615P-201ENST00000516065 PPFIA4O75335 1185 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 GGPS1O95749 300 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TIMP1P01033 207 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CD4P01730 458 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 GNA11P29992 359 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PSMC6P62333 389 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 AP3B2Q13367 1082 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NEDD9Q14511 834 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NTRK3Q16288 839 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 DGKDQ16760 1214 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 UBE2SQ16763 222 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MCTP2Q6DN12 878 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TDHQ8IZJ6 230 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PPTC7Q8NI37 304 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 BADQ92934 168 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PHKBQ93100 1093 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 GPRASP2Q96D09 838 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 IL17RAQ96F46 866 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CDHR1Q96JP9 859 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SPATA33Q96N06 139 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 C6orf50Q9HD87 102 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TBX21Q9UL17 535 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SCN5AQ14524 2016 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 B4GALT4O60513 344 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CDKL5O76039 1030 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 DEXIO95424 95 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SP2Q02086 613 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 FPGSQ05932 587 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 STK3Q13188 491 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SEMA3FQ13275 785 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PKN1Q16512 942 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MFSD5Q6N075 450 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 METTL7BQ6UX53 244 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 BICD2Q8TD16 824 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ANO3Q9BYT9 981 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MYO9BQ13459 2157 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SORBS3O60504 671 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PFKFB2O60825 505 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SEC24BO95487 1268 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ITGB5P18084 799 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ITGB8P26012 769 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ZNF76P36508 570 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SREBF1P36956 1147 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 PSEN2P49810 448 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 AK2P54819 239 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NLRP5P59047 1200 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CHMP4BP1P59074 171 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ARHGAP4P98171 946 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MTMR1Q13613 665 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MFSD10Q14728 455 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 C8orf34Q49A92 452 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 SESTD1Q86VW0 696 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TMEM199Q8N511 208 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 KAT2BQ92831 832 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 ALG1Q9BT22 464 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-615P-201ENST00000516065 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms