RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 GRB14Q14449 540 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 LETM2Q2VYF4 491 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR16Q569H4 304 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TLK2Q86UE8 772 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FERMT3Q86UX7 667 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 HSCBQ8IWL3 235 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 JAK2O60674 1132 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 GGPS1O95749 300 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 OATP04181 439 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SCG2P13521 617 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 RAG1P15918 1043 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 GNA11P29992 359 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRX1Q86UT6 975 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SEPT4O43236 478 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZEB2O60315 1214 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMC6P62333 389 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TKFCQ3LXA3 575 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SCFD2Q8WU76 684 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 AFG1LQ8WV93 481 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA33Q96N06 139 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PNMA2Q9UL42 364 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMYM6O95789 1325 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CCND2P30279 289 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf76Q96K31 380 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 BACH2Q9BYV9 841 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 BRCA2P51587 3418 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNA10Q16322 511 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF536O15090 1300 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 MSCO60682 206 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FGRP09769 529 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 OAZ1P54368 228 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CCL23P55773 120 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 MORN1Q5T089 497 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 AZI2Q9H6S1 392 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF3AQ9Y496 699 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ASGR1P07306 291 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 LIG1P18858 919 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ME3Q16798 604 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM161BQ96MY7 647 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 CTSHP09668 335 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF286BP0CG31 522 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 GJA8P48165 433 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 GUCA2AQ02747 115 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 TLE2Q04725 743 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 INF2Q27J81 1249 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf34Q49A92 452 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf31Q8N865 590 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 IL31RAQ8NI17 732 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 HLA-CQ95604 372 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP9BO43861 1147 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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