RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 ICAM3P32942 547 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGAP1Q07960 439 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 SNX17Q15036 470 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 PGBD1Q96JS3 809 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CTDNEP1O95476 244 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 GGPS1O95749 300 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 NEDD9Q14511 834 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 GALNT17Q6IS24 598 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 AFG1LQ8WV93 481 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 GPRASP2Q96D09 838 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 H0YGN5 161 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MAFGO15525 162 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF76P36508 570 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SREBF1P36956 1147 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM60Q495X7 471 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 AIFM3Q96NN9 605 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ITGB5P18084 799 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGAP4P98171 946 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SP2Q02086 613 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR1Q13613 665 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 DGKDQ16760 1214 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PPTC7Q8NI37 304 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SPATA33Q96N06 139 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ALG1Q9BT22 464 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 JADE2Q9NQC1 790 aa20.43■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ARVCFO00192 962 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MMP3P08254 477 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 TLE2Q04725 743 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ITGA7Q13683 1181 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CEP55Q53EZ4 464 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 BLIDQ8IZY5 108 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 TOX2Q96NM4 488 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SORBS3O60504 671 aa20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 SEMA3FQ13275 785 aa20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PPFIA4O75335 1185 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 CYP3A4P08684 503 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 MCM2P49736 904 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PSMC6P62333 389 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 METTL7BQ6UX53 244 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.4■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ALPK3Q96L96 1907 aa20.39■□□□□ 0.86
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTS3O15072 1205 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 JAK2O60674 1132 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 DTNBO60941 627 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CLTBP09497 229 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SYN1P17600 705 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CDK7P50613 346 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM29Q14134 588 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 MEIS1O00470 390 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP4BP1P59074 171 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ST3GAL1Q11201 340 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ATP9AO75110 1047 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KCNA2P16389 499 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 USP11P51784 963 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms