RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 EMC7Q9NPA0 242 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 IQGAP2Q13576 1575 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24D-211ENST00000511481 A0A087WZG4 1122 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SHOXO15266 292 aa6.33□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 LSSP48449 732 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 LRMPQ12912 555 aa6.33□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ASXL2Q76L83 1435 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PMM2O15305 246 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SIN3BO75182 1162 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 MX1P20591 662 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GBP1P32455 592 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 STYK1Q6J9G0 422 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.33□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 MTA3Q9BTC8 594 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 NOS1P29475 1434 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 MYOM1P52179 1685 aa6.33□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 ULK1O75385 1050 aa6.32□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 PIP4K2BP78356 416 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ODF1Q14990 250 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ALFQ53S48 1182 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 TTC22Q5TAA0 569 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 CCDC140Q96MF4 163 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 AAASQ9NRG9 546 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.32□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 PRR20CP86479 221 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PRR20DP86480 221 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PRR20BP86481 221 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PRR20AP86496 221 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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SEC24D-211ENST00000511481 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SYNJ2O15056 1496 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SHPRHQ149N8 1683 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PBRM1Q86U86 1689 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 AQP7O14520 342 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 GAS7O60861 476 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 SCG5P05408 212 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 FAM163BP0C2L3 166 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 TYRP1P17643 537 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ERVK-24P63145 666 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SEC24D-211ENST00000511481 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.31□□□□□ -1.4
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