RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 GRK3P35626 688 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 STAT5AP42229 794 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 HTRA3P83110 453 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 CHRNA2Q15822 529 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 VWA3BQ502W6 1294 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 EXOC2Q96KP1 924 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 GPR85P60893 370 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 KIZQ2M2Z5 673 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 EMC4Q5J8M3 183 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SOGA3Q5TF21 947 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC7Q99615 494 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1B0GTL3 188 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 KCNC2Q96PR1 638 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 KCNJ15Q99712 375 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MYOTQ9UBF9 498 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 KRIT1O00522 736 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TADA3O75528 432 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SOD2P04179 222 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 CAP1Q01518 475 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DPH6Q7L8W6 267 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 STK32CQ86UX6 486 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MKL1Q969V6 931 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SLC27A2O14975 620 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 GNAT1P11488 350 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 COL6A2P12110 1019 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SYT8Q8NBV8 401 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PTPRN2Q92932 1015 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ALG1Q9BT22 464 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 IPPKQ9H8X2 491 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DTLQ9NZJ0 730 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MAFKO60675 156 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 CR1LQ2VPA4 569 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 LCE4AQ5TA78 99 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 USP35Q9P2H5 1018 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SH3D21A4FU49 640 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 AQP7O14520 342 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SASH1O94885 1247 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 HOXA5P20719 270 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 LIPIQ6XZB0 460 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SP8Q8IXZ3 490 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 DRC1Q96MC2 740 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA25Q9BR10 227 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 SLURP1P55000 103 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-215ENST00000506510 ITGA1P56199 1179 aa7.06□□□□□ -1.28
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