RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA33Q96N06 139 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 C6orf50Q9HD87 102 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 RGS20O76081 388 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 GGPS1O95749 300 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNAR1P17181 557 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 ICAM3P32942 547 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 TDHQ8IZJ6 230 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PPTC7Q8NI37 304 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PHKBQ93100 1093 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PPFIA4O75335 1185 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TIMP1P01033 207 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 GNA11P29992 359 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 STK3Q13188 491 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 AP3B2Q13367 1082 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 BICD2Q8TD16 824 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIN2DO15399 1336 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MAFGO15525 162 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SORBS3O60504 671 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKL5O76039 1030 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 CD4P01730 458 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NTRK3Q16288 839 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM199Q8N511 208 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 GPRASP2Q96D09 838 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TBX21Q9UL17 535 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NOD1Q9Y239 953 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF76P36508 570 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SP2Q02086 613 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 FPGSQ05932 587 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ESYT2A0FGR8 921 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 B4GALT4O60513 344 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR1Q13613 665 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD5Q6N075 450 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL7BQ6UX53 244 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 C7orf31Q8N865 590 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ANO3Q9BYT9 981 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 HIPK3Q9H422 1215 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PPFIA3O75145 1194 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 DEXIO95424 95 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK4P51957 841 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PKN1Q16512 942 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC24BO95487 1268 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PSEN2P49810 448 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP5P59047 1200 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.454e-6■□□□□ 11.1
SH3BP2-210ENST00000505941 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 JADE2Q9NQC1 790 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGB8P26012 769 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 AK2P54819 239 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD10Q14728 455 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 PGBD1Q96JS3 809 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 ALG1Q9BT22 464 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM260Q9NX78 707 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF286BP0CG31 522 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 XBP1P17861 261 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGB5P18084 799 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 RETREG2Q8NC44 543 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 IL17RAQ96F46 866 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 PFKFB2O60825 505 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP2C18P33260 490 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 SREBF1P36956 1147 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA3FQ13275 785 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 PTGISQ16647 500 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP55Q53EZ4 464 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-210ENST00000505941 SESTD1Q86VW0 696 aa24.05■■□□□ 1.44
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