RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	MATN3	O15232	486 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	DDAH1	O94760	285 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	LRG1	P02750	347 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZNF20	P17024	532 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZNF28	P17035	718 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TNFRSF1A	P19438	455 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	IL13	P35225	146 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ6	P48051	423 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	GFRA1	P56159	465 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TESK1	Q15569	626 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	LGI4	Q8N135	537 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	SAMD11	Q96NU1	681 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	LTBR	P36941	435 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	NKX3-2	P78367	333 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	LSAMP	Q13449	338 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CPZ	Q66K79	652 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TEPP	Q6URK8	271 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CLDND1	Q9NY35	253 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZNF536	O15090	1300 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268		H7BY64	318 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	MSC	O60682	206 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CP	P00450	1065 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	GTF2A2	P52657	109 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PTPN18	Q99952	460 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	DTL	Q9NZJ0	730 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	MYO1B	O43795	1136 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	GJB6	O95452	261 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZXDA	P98168	799 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	EMC4	Q5J8M3	183 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PHF19	Q5T6S3	580 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	JAM3	Q9BX67	310 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CROT	Q9UKG9	612 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ICAM4	Q14773	271 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CDSN	Q15517	529 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	BORA	Q6PGQ7	559 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	PROSER1	Q86XN7	944 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CAPN10	Q9HC96	672 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PQU0	124 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	GPR42	O15529	346 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	FAM124A	Q86V42	546 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-222	ENST00000498268	SLC27A2	O14975	620 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	LAMTOR5	O43504	91 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	DLX3	O60479	287 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	COL6A1	P12109	1028 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	GRIN1	Q05586	938 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	FXN	Q16595	210 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	CD248	Q9HCU0	757 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	MYOT	Q9UBF9	498 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	DGKI	O75912	1065 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-222	ENST00000498268	VPS37D	Q86XT2	251 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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