RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 SEMA3FQ13275 785 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 PHF24Q9UPV7 400 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1W2PQY0 241 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 GGPS1O95749 300 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ASGR1P07306 291 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ICAM3P32942 547 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ACLYP53396 1101 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 SP2Q02086 613 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 GUCY1B3Q02153 619 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR1Q13613 665 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 OXER1Q8TDS5 423 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 GPRASP2Q96D09 838 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 JADE2Q9NQC1 790 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ALPK3Q96L96 1907 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 M0R2N6 131 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ZEB2O60315 1214 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 TGFB3P10600 412 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KRT2P35908 639 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 NKX3-2P78367 333 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KRT40Q6A162 431 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 C8orf76Q96K31 380 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MMP1P03956 469 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MYL3P08590 195 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CEP55Q53EZ4 464 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 TBCKQ8TEA7 893 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 AFG1LQ8WV93 481 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CDHR1Q96JP9 859 aa22.55■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 NR5A1Q13285 461 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 LAMC2Q13753 1193 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA33Q96N06 139 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.54■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 FAM86B1E9PN63 330 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MMP3P08254 477 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CYP3A4P08684 503 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 SP4Q02446 784 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 NEDD9Q14511 834 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.53■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 A6NJR5 290 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ATP9AO75110 1047 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ARP10275 920 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KCNA2P16389 499 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 GJB2P29033 226 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 INF2Q27J81 1249 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 PPTC7Q8NI37 304 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 DPF3Q92784 378 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 KIF3AQ9Y496 699 aa22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HLA-B-255ENST00000498007 BTBD18B2RXH4 712 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 MEIS1O00470 390 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 PRR16Q569H4 304 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 METTL7BQ6UX53 244 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 UIMC1Q96RL1 719 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.51■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.5■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 FAM205CA6NFA0 338 aa22.5■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 MAFGO15525 162 aa22.5■■□□□ 1.19
HLA-B-255ENST00000498007 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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