RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO11Q86XK2 927 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 BICD2Q8TD16 824 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 MTMR8Q96EF0 704 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PIGSQ96S52 555 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 AMNQ9BXJ7 453 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 BARHL2Q9NY43 387 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ABCB11O95342 1321 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 RASSF10A6NK89 507 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 RGS20O76081 388 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SMPD1P17405 629 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 GNA11P29992 359 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SEC13P55735 322 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 TREML2Q5T2D2 321 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf50Q9HD87 102 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ESYT2A0FGR8 921 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 VWA5AO00534 786 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PPFIA3O75145 1194 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ICAM1P05362 532 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SYT1P21579 422 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 KRT2P35908 639 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 NLRP5P59047 1200 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 DGKZQ13574 1117 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MCTP2Q6DN12 878 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 LBX2Q6XYB7 198 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CUL5Q93034 780 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CPVLQ9H3G5 476 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 RLFQ13129 1914 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SFI1A8K8P3 1242 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 STXBP3O00186 592 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PDHXO00330 501 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ATP2A1O14983 1001 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 BRD1O95696 1058 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MMP1P03956 469 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ADCY7P51828 1080 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 HERVK_113P62684 666 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PKN1Q16512 942 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 TKFCQ3LXA3 575 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 USH1GQ495M9 461 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC174Q6PII3 467 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 BRAPQ7Z569 592 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ATG4CQ96DT6 458 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ITPKCQ96DU7 683 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 BTBD19C9JJ37 291 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 DDIT3P35638 169 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CCNA1P78396 465 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 GRM1Q13255 1194 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MOGSQ13724 837 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 KRT40Q6A162 431 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MCTP1Q6DN14 999 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 CAPNS2Q96L46 248 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MAF1Q9H063 256 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO40Q9UH90 709 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CTPS1-211ENST00000497210 M0R2N6 131 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms