RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496277.5

CNIH3-211, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH3, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-211ENST00000496277 RASA3Q14644 834 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 EMC4Q5J8M3 183 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 STEAP3Q658P3 488 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 DCAF4Q8WV16 495 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.18□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SMARCA4P51532 1647 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 DGKIO75912 1065 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 STAT5AP42229 794 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 CHRNA2Q15822 529 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LCE1DQ5T752 114 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 STYK1Q6J9G0 422 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LIPIQ6XZB0 460 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SP8Q8IXZ3 490 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 JAM3Q9BX67 310 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.17□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SH3D21A4FU49 640 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 TADA3O75528 432 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SASH1O94885 1247 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 GRK2P25098 689 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 GRK3P35626 688 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SLURP1P55000 103 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 RBL2Q08999 1139 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LILRA6Q6PI73 481 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LBX2Q6XYB7 198 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 C20orf173Q96LM9 149 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SNTG2Q9NY99 539 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ASXL2Q76L83 1435 aa6.16□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 GPR85P60893 370 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 KIZQ2M2Z5 673 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 CR1LQ2VPA4 569 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SPATA25Q9BR10 227 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 MYOTQ9UBF9 498 aa6.15□□□□□ -1.42
CNIH3-211ENST00000496277 FAM153BP0C7A2 387 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 CTSWP56202 376 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 FAM209AQ5JX71 171 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 STK32CQ86UX6 486 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 CARFQ8N187 725 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 EXOC2Q96KP1 924 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 CDC6Q99741 560 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 DTLQ9NZJ0 730 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.14□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 THBS2P35442 1172 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KCNC1P48547 511 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ITGA1P56199 1179 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KCNJ15Q99712 375 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NTMQ9P121 344 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.13□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KRIT1O00522 736 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SLC27A2O14975 620 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 WIZO95785 1651 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SOD2P04179 222 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KYQ8NBH2 561 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms