RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494838.6

QARS-222, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene QARS, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-222	ENST00000494838	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PRC1	O43663	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	LIFR	P42702	1097 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	KCNJ6	P48051	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	NEDD9	Q14511	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	SCLY	Q96I15	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	GGPS1	O95749	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	GNAT1	P11488	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	SELP	P16109	830 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	IGFBP4	P22692	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PTGS1	P23219	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PSEN2	P49810	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	MFSD10	Q14728	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.55	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	OPLAH	O14841	1288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	FIBP	O43427	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	F2	P00734	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PTK7	Q13308	1070 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	KRT32	Q14532	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.54	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	BMP1	P13497	986 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	RBL2	Q08999	1139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
QARS-222	ENST00000494838	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	SLC27A2	O14975	620 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	CYTH3	O43739	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	ICAM3	P32942	547 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	PBX2	P40425	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	ANTXR2	P58335	489 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	KAT2B	Q92831	832 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838		H3BRB1	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	HAS3	O00219	553 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	MAFG	O15525	162 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	CAND2	O75155	1236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	FGD1	P98174	961 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	IKBKE	Q14164	716 aa		13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.5	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.5	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	CDC45	O75419	566 aa		13.5	□□□□□ -0.25
QARS-222	ENST00000494838	RGS20	O76081	388 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms