RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	CHD4	Q14839	1912 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM170A	A1A519	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PHACTR2	O75167	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GCNT3	O95395	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	NT5C2	P49902	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SMTN	P53814	917 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	INHBE	P58166	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CTSH	P09668	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MAPK4	P31152	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	FLT3LG	P49771	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CRHR2	Q13324	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	UBXN4	Q92575	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ZEB2	O60315	1214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF20A	O95235	890 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	RARB	P10826	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PFKFB1	P16118	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	POTEB3	A0JP26	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	POTEC	B2RU33	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CCP110	O43303	1012 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	FKTN	O75072	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	YEATS4	O95619	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PSAP	P07602	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TMOD1	P28289	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CASP1	P29466	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF165	P49910	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	OSTN	P61366	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	STRN3	Q13033	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PNOC	Q13519	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	NEDD9	Q14511	834 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MCM6	Q14566	821 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	POTEB	Q6S5H4	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MROH8	Q9H579	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ELP1	O95163	1332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417		E9PMD0	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ADCY3	O60266	1144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	COPB2	P35606	906 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	VEGFB	P49765	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	REST	Q13127	1097 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	LRRC41	Q15345	812 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	SYCP1	Q15431	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-215	ENST00000492417	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms