RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 KIF18BQ86Y91 864 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 FAM168AQ92567 244 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 GLI4P10075 376 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC15P60006 121 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 IGBP1P78318 339 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 CRY1Q16526 586 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 KCNMB1Q16558 191 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 TMEM177Q53S58 311 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 FYB2Q5VWT5 728 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 UBR7Q8N806 425 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 NETO2Q8NC67 525 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 RNF32Q9H0A6 362 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 CABP5Q9NP86 173 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 M0R2C6 588 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CBX4O00257 560 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SRGAP3O43295 1099 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PAX4O43316 350 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NTRK1P04629 796 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 GLI1P08151 1106 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A11P48066 632 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NFKB2Q00653 900 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DHCR24Q15392 516 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CHRNA2Q15822 529 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CBLCQ9ULV8 474 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 KRIT1O00522 736 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CYBBP04839 570 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PDE6AP16499 860 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CPEP16870 476 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 GPR19Q15760 415 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CHST14Q8NCH0 376 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TRAF5O00463 557 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 MAFKO60675 156 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SCNN1BP51168 640 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 GALK1P51570 392 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ERVFRD-1P60508 538 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 EMC4Q5J8M3 183 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SEC14L1Q92503 715 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 MCM8Q9UJA3 840 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 GAS7O60861 476 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 F2P00734 622 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 MPOP05164 745 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DBHP09172 617 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 COL6A2P12110 1019 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NR1I3Q14994 352 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 LCE3BQ5TA77 95 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 STEAP3Q658P3 488 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OSTM1Q86WC4 334 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PEX11GQ96HA9 241 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DSEQ9UL01 958 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 AMY2AP04746 511 aa6.92□□□□□ -1.3
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