RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 GNAT1P11488 350 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 NCAM1P13591 858 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 IRAK3Q9Y616 596 aa6.56□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ARVCFO00192 962 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 RFXAPO00287 272 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 CRTAMO95727 393 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 EPHB3P54753 998 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 TCEA2Q15560 299 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.55□□□□□ -1.36
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PTEN-204ENST00000487939 KCNJ15Q99712 375 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 IPPKQ9H8X2 491 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 CD320Q9NPF0 282 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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PTEN-204ENST00000487939 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 WNT9AO14904 365 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 CDC45O75419 566 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 TADA3O75528 432 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ASMTLO95671 621 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 KRT1P04264 644 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ASGR2P07307 311 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 FBLN1P23142 703 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PMLP29590 882 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 BRAPQ7Z569 592 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTEN-204ENST00000487939 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTEN-204ENST00000487939 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.54□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 RAPGEF3O95398 923 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 NCKAP1LP55160 1127 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ST5P78524 1137 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ZNF124Q15973 351 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 KCNA10Q16322 511 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ZNF385BQ569K4 471 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 MIB1Q86YT6 1006 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 DDX11Q96FC9 970 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 FANCLQ9NW38 375 aa6.53□□□□□ -1.36
PTEN-204ENST00000487939 B4E1Z4 1266 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 IGSF3O75054 1194 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 RFPL3O75679 317 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 NPTXRO95502 500 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TOX2Q96NM4 488 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 DSEQ9UL01 958 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TBX22Q9Y458 520 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 KCTD3Q9Y597 815 aa6.52□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TLDC2A0PJX2 215 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 DBX1A6NMT0 343 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ENPP3O14638 875 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 RASGRP1O95267 797 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 COL6A2P12110 1019 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 LINC00310P59036 64 aa6.51□□□□□ -1.37
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