RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC26A6Q9BXS9 759 aa30.73■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 C6orf50Q9HD87 102 aa30.73■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 STXBP3O00186 592 aa30.72■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 SORBS3O60504 671 aa30.72■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 NBPF20Q3BBV1 942 aa30.72■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.72■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 PPFIA4O75335 1185 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 RGS20O76081 388 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 GNA11P29992 359 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 EVCP57679 992 aa30.71■■■□□ 2.51
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CCZ1B-211ENST00000486840 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
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CCZ1B-211ENST00000486840 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 MCTP2Q6DN12 878 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.71■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 ICAM3P32942 547 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 STK3Q13188 491 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 PHKBQ93100 1093 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 HIPK3Q9H422 1215 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 TBX21Q9UL17 535 aa30.7■■■□□ 2.51
CCZ1B-211ENST00000486840 NID2Q14112 1375 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 CD4P01730 458 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 IFNAR1P17181 557 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF76P36508 570 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 AP3B2Q13367 1082 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 C7orf31Q8N865 590 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 BICD2Q8TD16 824 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 GPRASP2Q96D09 838 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 GRIN2DO15399 1336 aa30.69■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 B4GALT4O60513 344 aa30.68■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 CDKL5O76039 1030 aa30.68■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 MFSD5Q6N075 450 aa30.68■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDH10Q9P2E7 1040 aa30.68■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 MTMR1Q13613 665 aa30.67■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.67■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.67■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ALG1Q9BT22 464 aa30.67■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 MAFGO15525 162 aa30.66■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL7BQ6UX53 244 aa30.66■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 RETREG2Q8NC44 543 aa30.66■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa30.66■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 PSEN2P49810 448 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 SP2Q02086 613 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 MFSD10Q14728 455 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 HSDL1Q3SXM5 330 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 LRIT3Q3SXY7 679 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ANO3Q9BYT9 981 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa30.65■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ESYT2A0FGR8 921 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 PPFIA3O75145 1194 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ITGB8P26012 769 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP2C18P33260 490 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 SP4Q02446 784 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 TYW1BQ6NUM6 668 aa30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF286BP0CG31 522 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NLRP5P59047 1200 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 BFSP2Q13515 415 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA0753Q2KHM9 967 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ZMYND12Q9H0C1 365 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 JADE2Q9NQC1 790 aa30.63■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 DEXIO95424 95 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SHHQ15465 462 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NTRK3Q16288 839 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PTGISQ16647 500 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PGBD1Q96JS3 809 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa30.62■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP2C9P11712 490 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 XBP1P17861 261 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SDF4Q9BRK5 362 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM260Q9NX78 707 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.61■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 F2P00734 622 aa30.6■■■□□ 2.49
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