RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486471.1

ACTL6A-210, Transcript of actin like 6A, human

TSL 3

Gene ACTL6A, Length 1,077 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTL6A-210	ENST00000486471	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	ITGA1	P56199	1179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471		X6R8D5	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TBX1	O43435	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	FHL2	Q14192	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	STAT5A	P42229	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	SELENOP	P49908	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	ADAM9	Q13443	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	NCAPH	Q15003	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TESK1	Q15569	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	GPR42	O15529	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	B4GALT3	O60512	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	SCG5	P05408	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	BCL6	P41182	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CEP68	Q76N32	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACTL6A-210	ENST00000486471	CAPNS1	P04632	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ITGAV	P06756	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	NAT2	P11245	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZNF28	P17035	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	DIO2	Q92813	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	MUSK	O15146	869 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	IGSF3	O75054	1194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	HOXC12	P31275	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471		B2RBV5	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	TADA3	O75528	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	LCP1	P13796	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	GTF2A2	P52657	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	DPT	Q07507	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACTL6A-210	ENST00000486471	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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