RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 GOPCQ9HD26 462 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CHD4Q14839 1912 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF233A6NK53 670 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 A6NNZ2 444 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 DDAH1O94760 285 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MYBL1P10243 752 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 KIF5BP33176 963 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 GGT7Q9UJ14 662 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 USP21Q9UK80 565 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 BLIDQ8IZY5 108 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SELENOSQ9BQE4 189 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC1Q9NV70 894 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PMS1P54277 932 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 BARGINQ6ZT62 677 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 H7C1D1 291 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 EHHADHQ08426 723 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LETM2Q2VYF4 491 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FUKQ8N0W3 1084 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 XDHP47989 1333 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS16A8MUM7 142 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA3EO15041 775 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 UBA7P41226 1012 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ACCSLQ4AC99 568 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RMND1Q9NWS8 449 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 GMNCA6NCL1 334 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SLURP2P0DP57 97 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 DNM2P50570 870 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 9.8
CCSAP-204ENST00000483092 FERMT2Q96AC1 680 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM107AO95990 144 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 BTDP43251 543 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 KRT71Q3SY84 523 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SGSM3Q96HU1 749 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN11Q9UMQ6 739 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TMCO5BA8MYB1 307 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TM4SF1P30408 202 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DDR1Q08345 913 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TAF4BQ92750 862 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC189A1A4V9 331 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SKOR1P84550 965 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R5BQ15173 497 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf60Q5U649 245 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RNF217Q8TC41 542 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 YIPF3Q9GZM5 350 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ANO9A1A5B4 782 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DNM1LO00429 736 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 BAG3O95817 575 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NAPAP54920 295 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NSMCE1Q8WV22 266 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 HVCN1Q96D96 273 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MTRQ99707 1265 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 FAM167BQ9BTA0 163 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TSGA10Q9BZW7 698 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 STK38LQ9Y2H1 464 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 UPP2O95045 317 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 KIF11P52732 1056 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GPSM2P81274 684 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 QPCTQ16769 361 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ORC4O43929 436 aa17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms