RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARVCFO00192 962 aa29.05■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CDK7P50613 346 aa29.05■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ITGA7Q13683 1181 aa29.04■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 CDKL5O76039 1030 aa29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 CTDNEP1O95476 244 aa29.03■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC43A3Q8NBI5 491 aa29.03■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 GNA11P29992 359 aa29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRX1Q86UT6 975 aa29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 STK36Q9NRP7 1315 aa29.01■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SREBF1P36956 1147 aa29.01■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM126BQ8IXS8 530 aa29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPRASP2Q96D09 838 aa29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA33Q96N06 139 aa29.01■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 BICD2Q8TD16 824 aa28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 GDF15Q99988 308 aa28.99■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGAP4P98171 946 aa28.98■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NEDD9Q14511 834 aa28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 KAT2BQ92831 832 aa28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.97■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.97■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.97■■■□□ 2.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 B4GALT4O60513 344 aa28.95■■■□□ 2.22
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CHMP4BP1P59074 171 aa28.95■■■□□ 2.22
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