RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476089.1

ITGA4-207, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA4, Length 1,846 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-207ENST00000476089 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CXCL11O14625 94 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 FANCCQ00597 558 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SPATA1Q5VX52 437 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.93■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 POTECB2RU33 542 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 IRF6O14896 467 aa22.92■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.92■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 ATP1A3P13637 1013 aa22.92■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 POTEBQ6S5H4 581 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 KCNK18Q7Z418 384 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 GDAQ9Y2T3 454 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 PTPRFP10586 1907 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 MED24O75448 989 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 PSMD10O75832 226 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 BCRP11274 1271 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 STX17P56962 302 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TREML2Q5T2D2 321 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.91■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.9■■□□□ 1.26
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ITGA4-207ENST00000476089 MED15Q96RN5 788 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 RIT2Q99578 217 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 PXMP2Q9NR77 195 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.89■■□□□ 1.25
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ITGA4-207ENST00000476089 POTEIP0CG38 1075 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF18P17022 549 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA4-207ENST00000476089 ITGB5P18084 799 aa22.88■■□□□ 1.25
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