RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 KIF28PB7ZC32 967 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 GGPS1O95749 300 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B4P51659 736 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 SEC23AQ15436 765 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 SESTD1Q86VW0 696 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CAGE1Q8TC20 777 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 SPATA33Q96N06 139 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PIGSQ96S52 555 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 HAS3O00219 553 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PDE4AP27815 886 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PTH1RQ03431 593 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PPTC7Q8NI37 304 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 AMNQ9BXJ7 453 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MYO7AQ13402 2215 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 LINC01553A4QN01 128 aa13.03□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 THPOP40225 353 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PTK7Q13308 1070 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 LAMC2Q13753 1193 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PGM5Q15124 567 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 TICAM2Q86XR7 235 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MTMR8Q96EF0 704 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 KRT23Q9C075 422 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CD320Q9NPF0 282 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB5O15062 677 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 CYTH3O43739 400 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 GJB5O95377 273 aa13.02□□□□□ -0.33
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ACTB-209ENST00000473257 RBL2Q08999 1139 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.02□□□□□ -0.33
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ACTB-209ENST00000473257 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 C5orf42Q9H799 3197 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 TREHO43280 583 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 CYP21A2P08686 494 aa13.01□□□□□ -0.33
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ACTB-209ENST00000473257 SEMA3FQ13275 785 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 IKBKEQ14164 716 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 GRM4Q14833 912 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 AAK1Q2M2I8 961 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 RAD9AQ99638 391 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 CNNM2Q9H8M5 875 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 TRIOO75962 3097 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 RSPH10B2B2RC85 870 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 HIP1O00291 1037 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 LGR5O75473 907 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 UPP2O95045 317 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 LGALS2P05162 132 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 RSPH10BP0C881 870 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 POLR2MP0CAP2 368 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 CCND2P30279 289 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 ERVK-21P61565 698 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 GHRHRQ02643 423 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 SERINC5Q86VE9 423 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V0A1Q93050 837 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 MYL10Q9BUA6 226 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 KATNAL1Q9BW62 490 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 MLXIPQ9HAP2 919 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-209ENST00000473257 SETD4Q9NVD3 440 aa13□□□□□ -0.33
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