RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.8□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 CBLCQ9ULV8 474 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 CHRNA2Q15822 529 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 FYB2Q5VWT5 728 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 NETO2Q8NC67 525 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 MPOP05164 745 aa6.78□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 GPR19Q15760 415 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 STEAP3Q658P3 488 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF18BQ86Y91 864 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 CHST14Q8NCH0 376 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-208ENST00000472760 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.78□□□□□ -1.32
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PRPF40A-208ENST00000472760 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 PDE6BP35913 854 aa6.77□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.77□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 NUDT19A8MXV4 375 aa6.76□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC12A8A0AV02 714 aa6.75□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 OR14I1A6ND48 311 aa6.75□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 F2P00734 622 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 AMY2AP04746 511 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 GLI1P08151 1106 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 AMY2BP19961 511 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 EMC4Q5J8M3 183 aa6.75□□□□□ -1.33
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