RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 TROAPQ12815 778 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 SCN5AQ14524 2016 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 SGSM2O43147 1006 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TAP1Q03518 808 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MYO9BQ13459 2157 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TLL1O43897 1013 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 NBNO60934 754 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGEF15O94989 841 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TGFB3P10600 412 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 PTK7Q13308 1070 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 GBF1Q92538 1859 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 EPOPA6NHQ4 379 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 TNFRSF10AO00220 468 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ANTXR2P58335 489 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 RBL2Q08999 1139 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 IL27Q8NEV9 243 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 WNT8BQ93098 351 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CXCL10P02778 98 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 HIC1Q14526 733 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 KRT40Q6A162 431 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MAP4K1Q92918 833 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.27■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 DEFB103AP81534 67 aa22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TCTN1Q2MV58 587 aa22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MYL10Q9BUA6 226 aa22.26■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 LCHNA4D1U4 455 aa22.25■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.25■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MYH6P13533 1939 aa22.24■■□□□ 1.15
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SHQ1-206ENST00000471526 H3BRB1 525 aa22.24■■□□□ 1.15
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SHQ1-206ENST00000471526 TFF2Q03403 129 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 IKBKEQ14164 716 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 LY9Q9HBG7 655 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 LGALS2P05162 132 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 THPOP40225 353 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MBTPS1Q14703 1052 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 CASC1Q6TDU7 716 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TET1Q8NFU7 2136 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.23■■□□□ 1.15
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SHQ1-206ENST00000471526 PRC1O43663 620 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 STAM2O75886 525 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 ICAM3P32942 547 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 KIF5BP33176 963 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 GRB10Q13322 594 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 NEDD9Q14511 834 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SERINC5Q86VE9 423 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 CUL5Q93034 780 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K14Q99558 947 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.21■■□□□ 1.15
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