RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD1Q15327 319 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TDHQ8IZJ6 230 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDHR1Q96JP9 859 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SORBS3O60504 671 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFNAR1P17181 557 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK3Q13188 491 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEDD9Q14511 834 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C6orf50Q9HD87 102 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIN2DO15399 1336 aa22.64■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ICAM3P32942 547 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBX21Q9UL17 535 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPFIA3O75145 1194 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIMP1P01033 207 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNA11P29992 359 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AP3B2Q13367 1082 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPRASP2Q96D09 838 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOD1Q9Y239 953 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B4GALT4O60513 344 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPFIA4O75335 1185 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDKL5O76039 1030 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD4P01730 458 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SP2Q02086 613 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FPGSQ05932 587 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTRK3Q16288 839 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCTP2Q6DN12 878 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BICD2Q8TD16 824 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HIPK3Q9H422 1215 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ESYT2A0FGR8 921 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGB8P26012 769 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTMR1Q13613 665 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 METTL7BQ6UX53 244 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM199Q8N511 208 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANO3Q9BYT9 981 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAMA3Q16787 3333 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEC24BO95487 1268 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF286BP0CG31 522 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF76P36508 570 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PKN1Q16512 942 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MFSD5Q6N075 450 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C7orf31Q8N865 590 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGBD1Q96JS3 809 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAFGO15525 162 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM260Q9NX78 707 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEXIO95424 95 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGB5P18084 799 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSEN2P49810 448 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEK4P51957 841 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AK2P54819 239 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SP4Q02446 784 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEMA3FQ13275 785 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MFSD10Q14728 455 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALG1Q9BT22 464 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JADE2Q9NQC1 790 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LTBP2Q14767 1821 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 F2P00734 622 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP2C18P33260 490 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SREBF1P36956 1147 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NLRP5P59047 1200 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KAT2BQ92831 832 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms