RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPC1	479 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	TGFB3	P10600	412 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP1	Q07960	439 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	GDF15	Q99988	308 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	BACH2	Q9BYV9	841 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	FIBP	O43427	364 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ST18	O60284	1047 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CABYR	O75952	493 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CTDNEP1	O95476	244 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	GGPS1	O95749	300 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	XBP1	P17861	261 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ZNF76	P36508	570 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CHMP4BP1	P59074	171 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	LAMC2	Q13753	1193 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	MCTP2	Q6DN12	878 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		20.28	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ELP1	O95163	1332 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	STK36	Q9NRP7	1315 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902		A6NJR5	290 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS3	O15072	1205 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SYN1	P17600	705 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	BMP8B	P34820	402 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SP2	Q02086	613 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	WASF1	Q92558	559 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SPATA33	Q96N06	139 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		20.27	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	KPNA6	O60684	536 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ICAM3	P32942	547 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PSMC6	P62333	389 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP4	P98171	946 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	TLE2	Q04725	743 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MTMR1	Q13613	665 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	CDHR1	Q96JP9	859 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ALG1	Q9BT22	464 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		20.26	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	JAK2	O60674	1132 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MMP3	P08254	477 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ITGB5	P18084	799 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SREBF1	P36956	1147 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SEMA3F	Q13275	785 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ITGA7	Q13683	1181 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	NEDD9	Q14511	834 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SNX17	Q15036	470 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	DGKD	Q16760	1214 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	GPRASP2	Q96D09	838 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	JADE2	Q9NQC1	790 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		20.25	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ARVCF	O00192	962 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	FOSB	P53539	338 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SP4	Q02446	784 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	BLID	Q8IZY5	108 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PPTC7	Q8NI37	304 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		20.24	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	CEP55	Q53EZ4	464 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	GALNT17	Q6IS24	598 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		20.23	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	ST3GAL1	Q11201	340 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	TRIM29	Q14134	588 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	METTL7B	Q6UX53	244 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	SZT2	Q5T011	3432 aa		20.22	■□□□□ 0.83
USP19-210	ENST00000465902	LAMA3	Q16787	3333 aa		20.22	■□□□□ 0.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms