RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 MTMR1Q13613 665 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 TRIM29Q14134 588 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 SNX17Q15036 470 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 IL31RAQ8NI17 732 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 PPTC7Q8NI37 304 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 SPATA33Q96N06 139 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ARVCFO00192 962 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 CTAGE5O15320 804 aa23.48■■□□□ 1.35
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IMP4-209ENST00000462357 PPFIA4O75335 1185 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ARIH2O95376 493 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 AFG1LQ8WV93 481 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 JADE2Q9NQC1 790 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 H0YGN5 161 aa23.47■■□□□ 1.35
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IMP4-209ENST00000462357 SREBF1P36956 1147 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ITGA7Q13683 1181 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 NECAB1Q8N987 351 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 COPS5Q92905 334 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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IMP4-209ENST00000462357 CEP55Q53EZ4 464 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 METTL7BQ6UX53 244 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 BACH2Q9BYV9 841 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.46■■□□□ 1.35
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IMP4-209ENST00000462357 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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IMP4-209ENST00000462357 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 BLIDQ8IZY5 108 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 SDF4Q9BRK5 362 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 ALG1Q9BT22 464 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 KIF3AQ9Y496 699 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CYP3A4P08684 503 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CLTBP09497 229 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 USP11P51784 963 aa23.44■■□□□ 1.34
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IMP4-209ENST00000462357 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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IMP4-209ENST00000462357 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 TMEM260Q9NX78 707 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 LCTP09848 1927 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 ITGB5P18084 799 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CDK7P50613 346 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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IMP4-209ENST00000462357 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 PGBD1Q96JS3 809 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 MEIS1O00470 390 aa23.41■■□□□ 1.34
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IMP4-209ENST00000462357 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NOD1Q9Y239 953 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CTDNEP1O95476 244 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CHMP4BP1P59074 171 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 C7orf31Q8N865 590 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-209ENST00000462357 RAG1P15918 1043 aa23.39■■□□□ 1.33
IMP4-209ENST00000462357 PTGS1P23219 599 aa23.39■■□□□ 1.33
IMP4-209ENST00000462357 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.39■■□□□ 1.33
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