RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 STK3Q13188 491 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 STXBP2Q15833 593 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 AFG1LQ8WV93 481 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 IL17RAQ96F46 866 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM260Q9NX78 707 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRSQ13332 1948 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ELP1O95163 1332 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NJR5 290 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ARVCFO00192 962 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3CDO00329 1044 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP9AO75110 1047 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CD4P01730 458 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MYL3P08590 195 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHB4P54760 987 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 FGD1P98174 961 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ST3GAL1Q11201 340 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SCRN1Q12765 414 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA7Q13683 1181 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 HIC1Q14526 733 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL4Q14679 1199 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R5BQ15173 497 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SCFD2Q8WU76 684 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 KAT2BQ92831 832 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 BADQ92934 168 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 VWCEQ96DN2 955 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 AIFM3Q96NN9 605 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF2CQ99661 725 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO9BQ13459 2157 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SMCO2A6NFE2 343 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 B4GALT4O60513 344 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CTDNEP1O95476 244 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP3P08254 477 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CLTBP09497 229 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNAR1P17181 557 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CCND2P30279 289 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ICAM3P32942 547 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 BMP8BP34820 402 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 RCAN1P53805 252 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 AK2P54819 239 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 NAPAP54920 295 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SPC25Q9HBM1 224 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 BARHL2Q9NY43 387 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX21Q9UL17 535 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 B4DLN1 442 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0355O15063 1070 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 GGPS1O95749 300 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 GH1P01241 217 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 SCG2P13521 617 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB5P18084 799 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 NPY5RQ15761 445 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms