RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450493.1

TFIP11-208, Transcript of tuftelin interacting protein 11, human

TSL 4

Gene TFIP11, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFIP11-208	ENST00000450493	SEC23A	Q15436	765 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	IL25	Q9H293	177 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	HAS3	O00219	553 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RGS20	O76081	388 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GGPS1	O95749	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	WNT8B	Q93098	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	COG5	Q9UP83	839 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	LPXN	O60711	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	EFCAB14	O75071	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GJB5	O95377	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TRDN	Q13061	729 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	IKBKE	Q14164	716 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	PGM5	Q15124	567 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	HLA-C	Q95604	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	CCND2	P30279	289 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	THPO	P40225	353 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TRAF1	Q13077	416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	HIC1	Q14526	733 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GRM4	Q14833	912 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	PIGS	Q96S52	555 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RAD9A	Q99638	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ERICH2	A1L162	156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	LGR5	O75473	907 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SP2	Q02086	613 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	CYP21A2	P08686	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TGFB3	P10600	412 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ERVK-21	P61565	698 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TFIP11-208	ENST00000450493	SI	P14410	1827 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493		H3BRB1	525 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	CYTH3	O43739	400 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	AMH	P03971	560 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	LGALS2	P05162	132 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	CTSH	P09668	335 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TFIP11-208	ENST00000450493	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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